バイオインフォマティクス: 次世代シークエンス解析サーバ・ソフトウェア

次世代シークエンスデータ解析サーバ・ソフトウェア

次世代シーケンス (NGS : Next-Generation Sequencing) データの解析を行います。データ解析をはじめたい方、データ解析を内製化したい組織のため、解析システムの調達から運用まで、トータルで支援いたします。

サーバスペック一覧
オプションサービス
NGS解析ソフトウエア Amelieff Quick Start Package (QSP)
チケットサポート
お見積り・ご注文について

サーバスペック一覧

モデル	ミドルスペック	スタンダードプラス	スタンダード	エントリー

価格	お問い合わせ	お問い合わせ	お問い合わせ	お問い合わせ
CPU	Intel^® Xeon^® Gold (32Core 2.5GHz)	AMD Ryzen™ Threadripper™ (24Core 4.2GHz)	Intel^® Core™ Ultra9 (24Core 3.2GHz)	Intel^® Core™ i7 (10Core 1.7GHz)
メモリ	512 GB	256 GB	128 GB	64 GB
OS用SSD	2 TB	2 TB	1 TB	2 TB
HDD	実効 50 TB (RAID5)	実効 16 TB (RAID5)	実効 16 TB (RAID5)	－
解析例	シングルセルRNA-seq (Fastqファイルから) 空間的遺伝子発現解析全ゲノム解析などさまざまな解析に対応	空間的遺伝子発現解析シングルセルRNA-seq	RNA-seq シングルセルRNA-seq	RNA-seq シングルセルRNA-seq WESがん変異解析 ATAC-seq解析 WES遺伝性変異解析
OS	Ubuntu 24.04 LTS	Ubuntu 24.04 LTS	Ubuntu 24.04 LTS	Windows11 Pro 64bit
筐体	タワー型	タワー型	タワー型	ノート型
附属	UPS、モニター (24インチ)、マウス、キーボード			なし
保守	オンサイト保守3年
ソフトウエア	オプション			QSP 1プロトコル

Intel, Xeon, および Intel Core は、アメリカ合衆国およびその他の国におけるIntel Corporationまたはその子会社の商標または登録商標です。
AMD，Ryzen はAdvanced Micro Devices, Inc.の商標または登録商標です。

＜実行時間の目安＞

RNA-seq：2,000万リード (2 GB) のサンプルでは、QC～発現定量まで約40 min、6サンプルの発現マトリクスによる二群間比較解析・エンリッチメント解析を約10 minで実行
シングルセルRNA-seq：10,000細胞のサンプルでQC～クラスタリング、エンリッチメント解析までが約70 min、10,000細胞 x 10,000細胞の2サンプルの統合解析を約60 minで実行

オプションサービス

解析環境立ち上げやシステム稼働後の運用に踏み込んだサービスを提供いたします。バイオインフォマティクス企業ならではの高い専門性で、システム運用の現場で発生するさまざまなお困りごとを解消いたします。

システム運用管理サポート

＜サーバ専属管理者がいない場合におすすめ＞
当社が導入したサーバの利用方法に関するサポートサービスです。

【相談内容】: 初期設定から使い方のご説明までご対応可能です。サーバの各種設定、Linuxの基本操作、sshでのリモート接続設定、sambaでの共有ファイルサーバ設定などをお手伝いします。
【利用方法】: ご相談はメールにて承ります。リモート接続によるサポートに対応いたします。6ヶ月よりご契約いただけます。

VPN 構築支援

施設内のデータ解析サーバーに対し、施設外からセキュリティ基準に沿ったリモート接続環境の構築およびサポートを実施いたします。

NGS解析ソフトウエア Amelieff Quick Start Package (QSP)

NGSデータ解析の実績と論文に基づき作成し、複数のデータで検証した解析プロトコルを、簡単な入力とボタンクリックにより実行から解析結果の記録まで、１つの環境で完結するNGS解析ソフトウエアです。

スタンダードプロトコル

RNA-seq解析

シングルセルRNA-seq解析

その他：ATAC-seq解析、細菌叢解析

アドバンストプロトコル

空間的遺伝子発現解析

シングルセルレパトア解析

その他：WESがん変異解析、WES遺伝性変異解析

チケットサポート

QuickStartPackageに対する軽微なカスタマイズや解析に関するご相談などについて、チケット制によるサポートを提供いたします。

解析手順の修正やフローの変更などのサポート
プロットの調整や解析フローの変更など、ご希望に沿った修正対応を実施します。
想定外の結果が得られたとき、エラーになったときの相談対応
導入した解析の結果が想定と異なっていた時やエラーの原因が究明できない場合のサポート

チケットの活用例

プロットの表示対象遺伝子を絞り込むカスタマイズ
生物種のリファレンス追加対応
プロットの色味やサイズの調整
エラーに対する調査対応

お見積り・ご注文について

ご依頼方法

下記のお見積り・ご注文フォームに必要事項をご記入の上ご連絡ください。

お見積り・ご注文

掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
掲載されている製品について

【試薬】

試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。

試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。

【医薬品原料】

製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。