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シークエンス: 次世代シーケンス

AZENTAのシングルセル解析サービス

AZENTA

10x Genomics社のシングルセルソリューションは、さまざまなライフサイエンス研究分野においてゴールドスタンダードと言えるほど広く利用されています。アゼンタなら、すべてのシングルセルソリューション（ユニバーサル遺伝子発現、遺伝子発現Flex、エピクロマチン）に加え、その上流手順、下流手順にあたる、組織固定・分散・抽出、CITE-Seq、データ解析まで受託します。また、ライブラリ調製（cDNA増幅精製後）から、あるいはシーケンシングから、といった工程ごとの受託も承っています。

グローバルCRO認証をうけ、実績豊富な日本国内ラボによるサービスですので安心してご依頼いただけます。

  • 『10x Genomics シングルセル解析キャンペーン実施中』（日本国内ラボ実施）
    PDFのダウンロードはこちら

  • 『10x Genomics シングルセル解析遺伝子発現受託解析サービス』(日本国内ラボ実施)

    凍結送付のほか、持ち込み・出張解析に対応。分散済み細胞をご提出、GEM生成以降を当社にて実施する標準サービスだけでなく、増幅済みcDNAをご提出、後半のライブラリ調製からご依頼、あるいは調製済みライブラリをご提出、シークエンシングのみご依頼など、ご希望に応じてどの工程からでも承ります。

    また、ヒト全血からのPBMC調製、凍結組織からの核抽出・固定分散、FFPE組織からの細胞分散にもご対応いたします。

    まずはページ下部の「お問い合わせ窓口」または「 jutaku@fujifilm.com」までお問い合わせください。

バルクRNAシークエンスとシングルセルRNAシークエンスの違い

バルクRNAシークエンス

シングルセルRNAシークエンス

シングルセルRNAシークエンスでは、今までバルクRNAシークエンスでは、得られなかった様々な情報が取得できます。

10x GEM-X 技術について

10x Genomics Chromium X シリーズの概要

  • 最先端のハードウェアと最高のスループット・柔軟性でシングルセル能力を高め、数百～数百万の細胞を対象としたマルチオミクス解析を可能にしています。
  • 特長的な3つのソリューション
    • ユニバーサル遺伝子発現：生細胞を対象にして、様々な生物種で解析可能
    • 遺伝子発現Flex：組織・細胞を固定して柔軟な研究デザインを実現
    • エピクロマチン：シングルセルでオープンクロマチン領域解析も可能に
ソリューション ユニバーサル遺伝子発現 遺伝子発現Flex エピクロマチン
用途 遺伝子発現 遺伝子発現＋V(D)J　同時解析 左記アプリケーションのマルチプレックス 固定サンプルの遺伝子発現、４マルチプレックス 固定サンプルの遺伝子発現16マルチプレックス 固定サンプルの遺伝子発現任意マルチプレックス ATAC (オープンクロマチン領域解析) ATAC＋遺伝子発現　同時解析
試薬バージョン 3’ v4 5’v3 3’ v4 4-plex/
5’ v3 4-plex		 Flex 4-plex Flex 16-plex Flex n-plex Epi ATAC Epi Multiome
旧製品 シングルセルRNA-Seq シングルセルV(D)J (新製品) シングルセル遺伝子発現Flex、4BC シングルセル遺伝子発現Flex、16BC (新製品) シングルセルATAC v2 シングルセルマルチオームATAC＋GEX

柔軟な研究デザインが可能

▼ 次世代シーケンサー仕様：Illumina NovaSeqシリーズ、MGI Tech DNBSEQシリーズ

アプリケーション ライブラリ
タイプ		 シーケンシング仕様 データ量最小要件
(細胞当たりリードペア)		 解析細胞数１万とした時の、
サンプル当りデータ量取得目安
Read1 Index
i5		 Index
i7		 Read2
ユニバーサル遺伝子発現 GEX 28 10 10 90 20,000 NovaSeq S4, ~1/12レーン;
NovaSeqX 10B,~1/6 レーン
VDJ 28 10 10 90 5,000 *GEXライブラリに対して15 - 20%で混合
FB 28 10 10 90 5,000 *GEXライブラリに対して15 - 20%で混合
遺伝子発現Flex GEX 28 10 10 90 10,000 NovaSeq S4, ~1/24レーン;
NovaSeqX 10B,~1/12レーン
エピクロマチン マルチオームATAC 50 8 24 49 25,000 NovaSeq S4, ~1/10レーン;
NovaSeqX 10B,~1/5レーン
マルチオームGEX 28 10 10 90 20,000 NovaSeq S4, ~1/12レーン;
NovaSeqX 10B,~1/6レーン

アゼンタの強みとご注文までの流れ

アゼンタの強み

  • 2016年に北米で初めて受託サービスを提供
  • 2018年に日本国内で初めて生細胞を対象とした受託サービスを開始したため、経験実績が豊富
  • 世界で３社、国内唯一の10xGenomics社グローバルCROプログラムに採択されているため、質の高い試験を提供
  • アゼンタ国内ラボ実施
  • 組織固定・分散・PBMC抽出・核抽出、CITE-Seq、高次データ解析など、さまざまなオプションを提供

国内ラボで実施した生物種・細胞由来の例

  • ヒトPBMC
  • ヒト胃がん組織
  • マウス破骨細胞
  • ヒト/マウスiPS
  • マウス網膜組織
  • サル脳組織
  • マウス胎児生殖巣
  • ヒト脂肪細胞（シングル核RNA-Seq）
  • オルガノイド
  • ジェノグラフトモデル
  • 海洋生物（魚類、貝類、棘皮類）
  • 昆虫

オンライン相談から解析まで一貫して国内ラボで実施。どの工程でもアラカルトでご依頼可能。

ご相談・お見積りについて

シングルセル解析やその他のご相談は、下記フォームまたは、jutaku@fujifilm.comまでご連絡をお願いいたします。
WEB面談でのご相談やご説明についても随時受付ております。

お見積り・ご注文について

ご依頼方法

お見積りやお問合せについては、下記のお見積り・ご注文フォームに必要事項をご記入の上ご連絡いただくか、jutaku@fujifilm.comまでご連絡をお願いいたします。

お見積り・ご注文
  • 掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
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    【試薬】
    試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
    試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
    【医薬品原料】
    製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
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