Axiomジェノタイピングアレイ解析サービス(ジャポニカアレイ)
Axiomジェノタイピングアレイ解析サービスは、個別医療化研究を目的としたGWASやバイオバンキングのプロジェクト、農畜産物を対象にしたゲノム育種や血統解析のような、大規模なジェノタイピングに最適な解析サービスです。おなじみの日本人に特化したジャポニカアレイ® *1も実施可能です。
*1：ジャポニカアレイ は国立大学法人東北大学の登録商標です。
取り扱いアレイのラインアップ
充実したラインアップのアレイをご用意しております。
幅広い研究分野のお客様へご利用いただけるジェノタイピングサービスとして皆様の研究を強力にサポートいたします。
| 生物種 | 製品名 | マーカー数 |
|---|---|---|
| ヒト | Axiom™ Genome-Wide ASI Array Plate | 600,307 |
| Axiom™ Asia Precision Medicine Research Array | 750,000 | |
| イヌ | Axiom™ Canine HD Array | 712,893 |
| ニワトリ | Axiom™ Genome-Wide Chicken Genotyping Array | 580,961 |
| ウシ | Axiom™ Genome-Wide BOS 1 Genotyping Array（650K） | 648,855 |
| Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array | 63,988 | |
| ムギ | Axiom™ 384HT Wheat Genotyping Array | 35,000 |
| Axiom™ Wheat Breeder's Genotyping Array | 35,000 | |
| Axiom™ BreedWheat 35K Genotyping Array | 34,746 | |
| イチゴ | Axiom™ Strawberry Genotyping Array（90K） | 95,062 |
| イネ | Axiom™ Rice Genotyping Array | 48,000 |
| サーモン | Axiom™ Salmon Genotyping Array（130K） | 130,000 |
| 生物種 | 製品名 | マーカー数 |
|---|---|---|
| ヒト | Axiom™ Precision Medicine Diversity Array | 800,000 |
| Axiom™ Japonica Array™ Neo | 659,745 | |
| Axiom™ PangenomiX Array | 900,000 | |
| ブタ | Axiom™ Porcine Genotyping Array | 658,692 |
| Axiom™ Porcine Breeders Array | 55,232 | |
| ウマ | Axiom™ Equine Genotyping Array | 670,796 |
| ユーカリ | Axiom™ Eucalyptus Genotyping Array（72K） | 72,000 |
| トウモロコシ | Axiom™ Maize Genotyping Array | 616,201 |
| ダイズ | Axiom™ Soybean Genotyping Array | 180,961 |
| コットン | Axiom™ Cotton Genotyping Array | 35,550 |
| マス | Axiom™ Trout Genotyping Array 96 Format | 57,501 |
| Axiom™ Trout Genotyping Array 384 Format | 57,501 |
※記載に無い生物種のアレイもございます。詳しくはお問い合わせください。
ジャポニカアレイ®
日本人を特化としたジェノタイピングマイクロアレイである、ジャポニカアレイ ®も取り扱っております。
3,552人のWGSデータからデザインされた全く新しいジャポニカアレイ
日本人3,552人の全ゲノムデータから選択された65万tagSNPと日本民族集団特有の疾患関連 SNP情報が取得可能
文献等に基づく日本人特有の疾患関連SNPを搭載
本アレイは、疾患関連因子として研究報告があるSNPを、さまざまな文献やデータベースをもとに選別し、日本人にアレル頻度が一定以上で存在するSNPに絞り込みを行い、日本人特有の疾患関連SNPを搭載
日本人のゲノム解析に無駄のないマーカーを精選
搭載されたマーカーの99.5％以上が多型を示すことを検証、無駄のない設計であることを確認済
●マーカーの機能別搭載数 2.8万個の疾患マーカーを搭載
| 分類 | 搭載数（概数） |
|---|---|
| 精神神経系疾患 | 5,500 |
| 循環器系疾患 | 1,100 |
| 呼吸器系疾患 | 2,000 |
| 代謝系疾患 | 2,900 |
| 免疫系疾患 | 6,400 |
| 分類 | 搭載数（概数） |
|---|---|
| 眼科疾患 | 400 |
| ミトコンドリア病 | 60 |
| 泌尿器系疾患 | 300 |
| 消化器系疾患 | 400 |
| 産婦人科系疾患 | 200 |
| 分類 | 搭載数（概数） |
|---|---|
| 悪性新生物（腫瘍） | 900 |
| 遺伝性疾患 | 900 |
| 薬剤代謝 | 1,800 |
| HLA | 6,700 |
| KIR | 500 |
●マーカーの機能別搭載数 2.8万個の疾患マーカーを搭載
| 分類 | JPAv2（ジャポニカアレイ®v2） | ジャポニカアレイ®NEO |
|---|---|---|
| 対象マーカー数（コントロールマーカー除く） | 643,417 | 659,745 |
| 多型マーカー数 | 639,137 （99.3%） | 656,747 （99.5%） |
※ジャポニカアレイ®は国立大学法人 東北大学の登録商標です。
依頼の流れ
ご希望のアレイ種類やサンプル情報を問い合わせフォームやメールよりお知らせください。
1DNAの準備
お客様でご準備
● ゲノムDNA500ng以上 ● 濃度：50ng/μL以上 ● OD260/280 1.8-2.0 ● OD260/230 1.5以上
● 1%アガロースゲル電気泳動にて90％以上が10kbp以上のサイズ
※2本鎖DNAに特異的な濃度測定方法で測定ください
核酸抽出サービス（有償オプション）
培った核酸抽出技術を用い、高品質、低コストなサービスをご提供例）血液、鼻腔粘膜細胞、脂肪組織など
2サンプルQC
弊社でQCを実施
● サンプル量
蛍光法による測定
● サンプル品質
ゲル電気泳動による測定
※電気泳動は一部サンプルのみの実施
納品物
- 解析報告書
- Raw data(CEL)
- SNPジェノタイピング解析結果(txt,PED/MAP)
また、ご自身でジェノタイピングや、データをILMN形式に変更が可能な無料ソフトウェア「AXEL Tool」がライフテクノロジーズジャパン株式会社から提供されます。
お見積り・ご注文について
- 掲載内容は本記事掲載時点の情報です。仕様変更などにより製品内容と実際のイメージが異なる場合があります。
- 掲載されている製品について
- 【試薬】
- 試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
- 試験研究用以外にご使用された場合、いかなる保証も致しかねます。試験研究用以外の用途や原料にご使用希望の場合、弊社営業部門にお問合せください。
- 【医薬品原料】
- 製造専用医薬品及び医薬品添加物などを医薬品等の製造原料として製造業者向けに販売しています。製造専用医薬品(製品名に製造専用の表示があるもの)のご購入には、確認書が必要です。
- 表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
- 表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。