Universal Linker 『PT Linker Support』
PTリンカー（PhenanThrene-type Linker）は、オリゴヌクレオチド合成のためのユニバーサルリンカーです。このリンカーは、フェナントレンを含む二環性1,2-ジオール構造と、固相担体とフェナントレンをアミド結合により連結するためのスクシニルユニットから構成されています。脂溶性が高く、UV検出可能なフェナントレン骨格を持つため、目的のオリゴヌクレオチドとリンカー由来の不純物成分を容易に分離することができます。1)2)
PTリンカーの構造
脂溶性が高く、UV検出可能な
フェナントレン骨格
特長
- PT由来の各成分の検出と目的物との分離が容易
- 従来のユニバーサルリンカーと同じ反応条件で利用可能
- マレイミド（MI）型ユニバーサルリンカーの開環問題を解決
ユニバーサルリンカーからのオリゴヌクレオチドの切り出しメカニズム
ユニバーサルリンカーの比較
種類
Phenanthrene-type (PT) Linker
Maleimide-type (MI) Linker
塩基処理後に想定される PT Linker 由来の生成物
(未放出体)
塩基処理後に想定されるMI型リンカー由来の生成物
| 閉環 |  |
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| 開環 |  |
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| oligonucleotide-MI (未放出体) |
p-MI | cp-MI | MI |
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オリゴヌクレオチド合成：DMTr-off モード
Figure 2 HPLC analysis of ONs released from T10-loaded (a) MI Linker CPG (R=Me) and (b)(c) PT Linker CPG after treatment with 28% NH3 (aq.) at rt for 2 h. HPLC analytical conditions: (a) 5-15% (b) 8-18% (c) 5-50% Acetonitrile in 0.1 M TEAA (pH 7.0) over a linear gradient for 30 min.
反応例
オリゴヌクレオチド（T10）の合成 （DMTr-off モード）
Figure 3 HPLC analysis of ONs released from T10-loaded PT Linker CPG under Basic conditions A and B. Basic condition A: (a),(b) 28% NH3 (aq.) at 55℃ for 8 h; Basic condition B: (c) AMA at 65℃ for 1 h. HPLC analytical conditions: (a),(c) 8-18% (b) 5-50% Acetonitrile in 0.1 M TEAA (pH 7.0) over a linear gradient for 30 min.
3‘末端に様々なヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドの合成 （DMTr-off モード）
Figure 4 HPLC analysis of ONs released from CPG 1-5 after treatment with 28% NH3 (aq.) at 55℃ for 8 h. HPLC analytical conditions: 8-18% Acetonitrile in 0.1 M TEAA (pH 7.0) over a linear gradient for 30 min.
オリゴヌクレオチド（s-oligo）の合成 （DMTr-off モード）
Figure 5 HPLC analysis of ONs released from s-oligo-loaded (a) MI Linker CPG (R=Me) and (b)(c) PT Linker CPG under Basic conditions A and B. Basic condition A: (a),(b) 28% NH3 (aq.) at 55℃ for 3 h; Basic condition B: (c) 28% NH3 (aq.) at 55℃ for 8 h. HPLC analytical conditions: 5-25% Acetonitrile in 0.1 M TEAA (pH 7.0) over a linear gradient for 30 min.
4種のヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド（12 mer）の合成 （DMTr-off モード）
Figure 6 HPLC analysis of ONs released from oligo-loaded PT Linker CPG under Basic conditions (a) 28% NH3 (aq.) at 55℃ for 8 h and (b) 20% Diethylamine (DEA) in Acetonitrile at rt for 10 min then 28% NH3 (aq.) at 55℃ for 8 h. HPLC analytical conditions: 8-18% Acetonitrile in 0.1 M TEAA (pH 7.0) over a linear gradient for 30 min.
参考文献
- Fuchi, Y., Yamamoto, K., Ito, Y. and Hari, Y. : Synthesis, 55, 1112 (2023).
- 張 功幸 : 和光純薬時報, 92 (4), 2 (2024).
製品一覧
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固相担体：CPG
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